多平臺、多方法RNA文庫構建

RNA是以DNA的一條鏈為模板，以堿基互補配對原則，轉錄而形成的一條單鏈，主要功能是實(shí)現遺傳信息在蛋白質(zhì)上的表達，是遺傳信息傳遞過(guò)程中的橋梁，主要存在于生物細胞以及部分病毒、類(lèi)病毒中。

眾所周知，total RNA中95%以上都是核糖體RNA（rRNA），可rRNA卻非常保守，在不同的組織、器官當中的表達極度穩定； 而只占total RNA總量2%-3%的mRNA在RNA當中信息含量卻最為豐富，因此mRNA成為人們在科學(xué)研究中的重要關(guān)注點(diǎn)。

組織或細胞總RNA中各種RNA分布餅狀圖

而某個(gè)物種的特定組織或細胞在某一生理功能狀態(tài)下發(fā)生的mRNA產(chǎn)物的轉錄，即轉錄組，是基因組遺傳信息傳遞和表達的重要步驟和過(guò)程。

通過(guò)高通量mRNA測序可以獲得大量轉錄本序列信息，定量基因轉錄表達水平，獲得基因組轉錄區域及其位點(diǎn)信息等，在基因組序列拼接注釋、樣品間基因轉錄差異表達及其功能研究等方面有重要作用?？蓮恼w水平研究基因功能以及基因結構，揭示特定生物學(xué)過(guò)程以及疾病發(fā)生過(guò)程中的分子機理，已被廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。

RNA樣本的建庫質(zhì)量對于后續上機測序至關(guān)重要，可直接影響后續結果的分析。因此，一個(gè)好的建庫試劑盒對于RNA測序至關(guān)重要。全式金目前已推出2款RNA建庫試劑盒，分別適用于Illumina和MGI平臺，均具有高數據質(zhì)量、高文庫轉化率的特點(diǎn)。

快速RNA建庫  

?  TransNGS^? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina^? 

針對Illumina高通量測序平臺開(kāi)發(fā)的專(zhuān)用于構建鏈特異性或非鏈特異性轉錄組文庫的試劑盒，可一步完成二鏈合成、末端修復與加A反應，中間不需要純化步驟，極大地簡(jiǎn)化了操作流程，縮短了建庫時(shí)間，可在3 h之內將0.1 ng-100 ng處理后的RNA構建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。

● 文庫構建原理示意圖

● 與競品的比較

使用 mRNA 純化試劑盒對人、小鼠、小麥和煙草的總RNA進(jìn)行mRNA捕獲，其中人和小鼠投入200 ng總RNA，小麥和煙草投入1000 ng總RNA；分別使用TransGen和Company V建庫試劑盒進(jìn)行RNA文庫構建，文庫分選后檢測文庫產(chǎn)量、峰型，并進(jìn)行測序分析。

? 文庫產(chǎn)量

? 建庫峰型

?測序數據質(zhì)量

?相關(guān)性分析

?   TransNGS^? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for MGI^?

本產(chǎn)品是針對MGI高通量測序平臺開(kāi)發(fā)的專(zhuān)用于構建鏈特異性或非鏈特異性轉錄組文庫的試劑盒，可一步完成二鏈合成、末端修復與加A反應，中間不需要純化步驟，簡(jiǎn)化了操作流程，縮短了建庫時(shí)間，可在3 h之內將0.1 ng-100 ng處理后的RNA構建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。

● 文庫構建原理示意圖

● 與競品的比較

使用TransGen和Company Y產(chǎn)品進(jìn)行RNA建庫，比較不同投入量、不同物種、不同完整度RNA 建庫效果。TransGen 產(chǎn)品在產(chǎn)量上較競品有較大優(yōu)勢，適配不同物種、不同質(zhì)量的RNA 的樣品，片段化條件兼容性強，各種類(lèi)鏈特異性文庫中的鏈特異性占比都在98% 以上，測序數據質(zhì)量?jì)?yōu)異。

?文庫產(chǎn)量

?文庫峰型

?測序數據質(zhì)量

相關(guān)產(chǎn)品推薦

?   TransNGS^? rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

●產(chǎn)品特點(diǎn)   

? 可有效去除人/小鼠/大鼠高達99%的ribosomal RNA。

? 提供Control qPCR Primer Sets，檢測去除前后ribosomal RNA和非ribosomal RNA含量的變化。

●穩定性數據

       分別使用不同批次產(chǎn)品對1 μg 總RNA (HepG2 細胞) 進(jìn)行rRNA 去除 ，并使用rRNA Primer 和Non-rRNA Primer 對未去除和去除后的RNA 樣品同時(shí)進(jìn)行qRT-PCR 檢測，根據不同引物的ΔCq 值變化( 去除后樣品Cq 值減去未去除樣品Cq 值) 判斷產(chǎn)品批次間的穩定性，不同批次間ΔCq 值無(wú)明顯差異，產(chǎn)品批次間穩定性好。

●與競品的比較

1 μg人(Human, H)、小鼠(Mouse, M)和大鼠(Rat, R)總RNA樣品，分別使用TransGen和Company K產(chǎn)品去除rRNA后，進(jìn)行建庫(TransGen, KP601)測序及分析，結果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數據質(zhì)量上與競品相比，性能一致，甚至優(yōu)于競品。

?  MagicPure^? mRNA Kit

●產(chǎn)品特點(diǎn)   

? mRNA捕獲效率高

?樣本兼容性好

?測序數據質(zhì)量高

? 適用物種廣泛

●文庫產(chǎn)量

使用TransGen mRNA 純化試劑盒 (EC511)、Company V 及Company Y 同類(lèi)產(chǎn)品對不同投入量及不同物種進(jìn)行mRNA 捕獲后建庫，結果顯示，TransGen 產(chǎn)品mRNA 得率高，純度高，搭配建庫試劑盒，文庫產(chǎn)量更高，測序數據質(zhì)量更好

產(chǎn)品信息