文章信息
文章題目:Inheritance of acquired adaptive cold tolerance in rice through DNA methylation
期刊:Cell
發(fā)表時(shí)間:2025年5月22日
主要內容:中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所曹曉風(fēng)院士團隊在 Cell 雜志發(fā)表題為 Inheritance of acquired adaptive cold tolerance in rice through DNA methylation 的研究論文。該研究以水稻北移種植過(guò)程中的耐冷適應性為模型,揭示了低溫誘導 DNA 甲基化變異介導了耐冷適應性狀獲得及穩定遺傳的分子機制。首次為拉馬克獲得性遺傳理論提供了直接證據,并為作物抗逆改良開(kāi)辟了新途徑。
原文鏈接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00506-9
使用TransGen產(chǎn)品:
pEASY?-Blunt Cloning Kit (CB101)
研究背景
物種在多變環(huán)境下的適應性進(jìn)化作為進(jìn)化生物學(xué)研究的核心科學(xué)問(wèn)題,早在達爾文提出自然選擇學(xué)說(shuō)的半個(gè)多世紀之前,法國進(jìn)化論先驅拉馬克就創(chuàng )立了獲得性遺傳理論,該理論認為生物體能主動(dòng)適應環(huán)境變化并將有利性狀遺傳給后代,但因缺乏分子遺傳學(xué)證據長(cháng)期備受爭議。以起源于熱帶亞熱帶地區的水稻為例,其向高緯度擴展種植時(shí)面臨低溫適應性挑戰,常出現結實(shí)率驟降等問(wèn)題。傳統觀(guān)點(diǎn)認為,這一適應過(guò)程是通過(guò)長(cháng)期的人工馴化逐步實(shí)現的,主要涉及關(guān)鍵功能基因蛋白質(zhì)序列的漸進(jìn)性改變。盡管表觀(guān)遺傳調控等分子機制也參與水稻的短期低溫響應,但尚無(wú)證據表明其直接參與了水稻的長(cháng)期低溫環(huán)境適應。
文章概述
為了模擬水稻北移的演化過(guò)程,研究團隊通過(guò)在水稻減數分裂期施加多代連續冷脅迫篩選,成功培育出耐冷性顯著(zhù)增強且性狀穩定的株系。該獲得性性狀呈顯性遺傳,并能在常溫下穩定遺傳至少五代。多組學(xué)分析揭示,ACT1 基因啟動(dòng)子區甲基化缺失使其表達不受低溫抑制,且 F2 代群體分析顯示 ACT1 甲基化水平與耐冷性高度相關(guān)。通過(guò)靶向編輯該位點(diǎn)甲基化狀態(tài),成功實(shí)現了耐冷性的定向調控,確證了表觀(guān)遺傳突變的因果性。研究發(fā)現,低溫通過(guò)抑制 DNA 甲基轉移酶 MET1b 表達,導致 ACT1 啟動(dòng)子區甲基化維持受阻,形成低甲基化表觀(guān)等位型。進(jìn)一步研究發(fā)現,ACT1 啟動(dòng)子的甲基化變異區域存在轉錄因子 Dof1 的結合位點(diǎn),其結合對 DNA 甲基化敏感。Dof1 為一個(gè)受冷誘導表達的激活型轉錄因子,敲除后顯著(zhù)降低孕穗期的耐冷能力。這些發(fā)現揭示了完整的冷適應調控通路:低溫脅迫下調甲基轉移酶 MET1b 的表達,引發(fā) ACT1 啟動(dòng)子 DNA 甲基化丟失,促進(jìn) Dof1 的結合,從而激活 ACT1 表達,賦予水稻耐冷性。自然變異分析發(fā)現 ACT1 基因序列保守但甲基化呈現多態(tài)性,且與耐冷性顯著(zhù)相關(guān)。對中國三大稻區 131 份農家種的分析顯示,低緯度的華南、華中稻區 88% 以上品種攜帶高甲基化 ACT1,而高緯度的東北稻區則顯著(zhù)富集低甲基化 ACT1。這種"南高北低"的甲基化梯度分布表明,ACT1 表觀(guān)變異可能是水稻北遷冷適應的關(guān)鍵馴化位點(diǎn)。
ACT1 位點(diǎn)甲基化變異促進(jìn)水稻向高緯度地區擴張
該研究發(fā)現了冷脅迫可誘發(fā)水稻產(chǎn)生穩定遺傳的 DNA 甲基化變異,促進(jìn)其適應高緯度區域的低溫氣候,揭示了物種通過(guò)表觀(guān)遺傳變異快速適應環(huán)境變化的分子基礎,為拉馬克獲得性遺傳理論提供了分子層面上的直接證據。正如一位審稿人對該工作的評述:"超越了傳統達爾文進(jìn)化理論框架,為理解適應性進(jìn)化提供了新范式"。同時(shí),該研究闡明了表觀(guān)自然變異對作物耐逆適應性的關(guān)鍵調控作用,創(chuàng )建了"逆境馴化-表型篩選-變異鑒定-精準編輯"的作物定向抗逆育種新思路,為應對氣候變化下的農業(yè)挑戰提供了創(chuàng )新解決方案。
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使用 pEASY?-Blunt Cloning Kit (CB101) 產(chǎn)品發(fā)表的部分文章:
? Song X W, Tang S J, Liu H, et al. Inheritance of acquired adaptive cold tolerance in rice through DNA methylation[J]. Cell, 2025.(IF 45.6)
? Liu J, Lu J, Zhang C, et al. Tandem intermolecular [4+ 2] cycloadditions are catalysed by glycosylated enzymes for natural product biosynthesis[J]. Nature Chemistry, 2023.(IF 21.80)
? Li Q, Lu J, Yin X, et al. Base editing-mediated one-step inactivation of the Dnmt gene family reveals critical roles of DNA methylation during mouse gastrulation[J]. Nature Communications, 2023.(IF 17.69)
? Wen R, Wang S, Wang K, et al. Complete gene sequence and mechanical property of the fourth type of major ampullate silk protein[J]. Acta Biomaterialia, 2023.(IF 10.63)
? Zheng Z, Wang B, Zhuo C, et al. Local auxin biosynthesis regulates brace root angle and lodging resistance in maize[J]. New Phytologist, 2023.(IF 10.32)
? Li J, Yuan J, Li Y, et al. The CDC48 complex mediates ubiquitin-dependent degradation of intra-chloroplast proteins in plants[J]. Cell Reports, 2022.(IF 9.4)
? He M, Su J, Xu Y, et al. Discovery of broad-spectrum fungicides that block septin-dependent infection processes of pathogenic fungi[J]. Nature Microbiology, 2020.(IF 15.54)